En 2001, l’Université Laurentienne de Sudbury décerna à Bernard Voyer un Doctorat honorifique pour sa contribution remarquable en géographie. Cette distinction est remise aux personnes ayant atteint un haut degré d’excellence dans leur carrière.
En 2005, l’Université du Québec (UQAR) lui décerna également un doctorat honorifique.